Jeszcze raz. Weź kurs, książkę i poczytaj sobie. Tak ciężko Ci pomóc pomimo chęci. Użyję tu trochę uproszczeń, ale może coś zrozumiesz. Skrypt PHP działa na serwerze i generuje HTML czy treść która leci do przeglądarki. Czyli otwierasz przeglądarkę, ona pyta serwer www.nierozumiemjaktodziala/zapiszdobazyto co ma wysłać w odpowiedzi i tutaj działa PHP czyli np. komunikuje się z bazą danych, wykonuje jakieś obliczenia itp. Potem raz przygotowaną odpowiedź wysyła do przeglądarki. Ta odpowiedź już nie jest modyfikowalna, kod PHP zrobił swoje i przygotował odpowiedź i już więcej razy się nie wykona dopóki ponownie nie będziesz chciał wyświetlić strony i nie naciśniesz np. odśwież w przeglądarce. Dalej przeglądarka odczytuje tą odpowiedź i wyświetla. Ta odpowiedź może zawierać jakiś kod JS - bo odpowiedź to nic innego jak np. HTML + CSS + JS. Przeglądarka wyświetla HTML, formatuje jakoś ten HTML zgodnie z tym co ma w CSS i ewentualnie wykonuje kod JS. Czyli jeszcze raz PHP wykonuje się po stronie serwera, JS po stronie przeglądarki - komputera gdzie wyświetlają się dane. JS nic nie wie o tym co się stało na serwerze. Nie wie, że tam jest jakieś PHP. Nie można więc w ten sposób łączyć kodu JS i PHP. Nie można i już.
Żeby zrobić coś co powinno wykonać się po stronie serwera musisz znów się z nim skomunikować i powiedzieć mu: hej serwer, weź mi tam wywołaj stronę
www.nierozumiemjaktodziala/zapiszdobazy
i przesyłam CI te dane.

Także jeszcze raz. Ogarnij podstawy bo będziesz to 2 lata robił i nie zrobisz, bo się tak nie da. Żeby Ci pomóc musisz nauczyć się podstaw podstaw.

P.S.
Mam nadzieję, że nikt mnie nie będzie ścigał za te uproszczenia.